Ce cours de deux jours vous montrera comment configurer et utiliser le module biobanque de LabVantage. Il commence par des explications sur les concepts de sécurité de base qui constituent le fondement de la solution biobanque de LabVantage. Vous découvrirez comment créer des données de base, un vocabulaire contrôlé, des emplacements de stockage et bien d'autres choses encore. Des options sont présentées pour l’utilisation du stockage et de la logistique avancés (ASL), des kits, du protocole et des requêtes ad hoc. Des exercices pratiques scénarisés fournissent des exemples concrets de la façon dont les échantillons peuvent être attribués pour une étude, obtenus avec les informations requises, suivis sous forme d’aliquote et inventoriés.

Public cible

Le module biobanque proposé par LabVantage est une extension du logiciel LIMS de base. Les thèmes présentés intéresseront aussi bien les utilisateurs finaux que les administrateurs. L’administration du module biobanque est l’objectif principal de la première journée. Le deuxième jour sera consacré à la réalisation d'opérations de laboratoire exécutées par les utilisateurs finaux. Les personnes responsables de l’administration de la solution de biobanque doivent suivre le cours 121-Administration ou 101-Utilisateur final pour une compréhension complète des fonctionnalités disponibles en plus de ce module.

1. Introduction : de quelle manière le module biobanque étend-il le noyau de LabVantage ? En quoi cela change-t-il ma façon de travailler avec LabVantage ? Qu’est-ce qu’un service de garde et comment cela m’affecte-t-il ? Mise en place de la sécurité des utilisateurs pour les biobanques.
2. Études : qu'est-ce qu'une étude de biobanque ? Contrôler le comportement d’une étude. Créer une étude.
3. Données de référence : comment les types d'échantillons affectent-ils le comportement du module biobanque lorsque les échantillons sont traités au laboratoire ? Définir le type de préparation, les types de traitement, les méthodes de collecte, les types de conteneurs et les types d'essais en tant qu'administrateur de laboratoire.
4. Vocabulaire contrôlé : qu’est-ce qu’une ontologie ? Comment s'assurer que tous les membres de notre laboratoire accèdent aux échantillons ou les cataloguent en utilisant le même langage, notamment en ce qui concerne le diagnostic clinique, le diagnostic microscopique, les types de tissus, les organes, les métastases et les espèces ?
5. Allocation d’échantillons : début du cycle de vie d’un échantillon. Avant de collecter et d’étiqueter des échantillons, vous devez définir les types et le nombre d’échantillons que vous avez l’intention de collecter pour une étude.
6. Stockage : avant de recevoir un échantillon, vous devez définir l’endroit où les échantillons seront stockés, notamment les conditions environnementales.
7. ASL : Advanced Storage and Logistics montre comment configurer le suivi par gel-dégel, configurer et suivre les expéditions d’échantillons, utiliser la page TISM et appliquer des règles de stockage avancées.
8. Réception de l’échantillon : lorsqu’un échantillon physique est apporté au laboratoire, il est enregistré dans un endroit et un domaine de garde lui est attribué. Découvrez comment réaliser cette deuxième phase du cycle de vie d’un échantillon.
9. Acquisition : avant d’accepter un échantillon dans une étude, certains éléments d’information doivent être enregistrés et examinés. À l'aide des données de référence et du vocabulaire contrôlé, découvrez comment cataloguer l'échantillon.
10. Opérations de laboratoire : Maintenant qu’un échantillon a été approuvé pour être utilisé dans une étude, l’étape suivante consiste à aliquote ou diviser, à créer un dérivé ou un pool, à ajouter des tests et saisir les résultats, ainsi qu'à assurer le suivi de l’inventaire.
11. Requêtes ad hoc : entrer des données dans le système est une chose. Exploiter la base de données pour les retrouver ou les consolider en est une autre. Découvrez comment naviguer dans la structure des données et concevoir des recherches pour vous aider à accéder plus rapidement aux données.
12. Kits : ce module optionnel supplémentaire vous permet de garder une trace des artefacts pour la collecte d'échantillons et de les regrouper tels que des seringues, des flacons, des écouvillons, des gobelets et d'autres contenants.
13. Protocole : lorsqu’un essai clinique est réalisé, il est important de faire le suivi des participants ou des sujets, des visites à l’hôpital ou des points temporels de collecte, et de garder le contrôle du programme. Ce module optionnel supplémentaire vous permet de gérer ces données organisationnelles dans LabVantage Biobanque.

Agenda

Le matériel

Vous recevrez une copie des documents de présentation au format PDF. Le manuel de l’étudiant contient des exercices scénarisés que vous pouvez réaliser.