Les données sont au cœur de toute opération de laboratoire, que vous ayez un seul site ou plusieurs laboratoires répartis dans le monde entier. Mais un élément clé de votre succès est la façon dont vous stockez et gérez ces données. La façon dont vous rassemblez toutes ces informations peut faire la différence entre un laboratoire qui tourne bien et un cauchemar organisationnel.
Pour illustrer cela, jetons un coup d’œil à une configuration de stockage de données typique et aux problèmes courants qu’elle crée.
Trois types d’instruments
Que vous disposiez de plusieurs laboratoires ou d’un seul, il est probable qu’il y ait plusieurs espaces où des analyses sont effectuées. Chaque processus fera appel à un ou plusieurs instruments, qui peuvent être regroupés en trois grands types :
1. Instruments « muets »
Ces appareils ne disposent pas d’une solution logicielle ou d’un PC dédié. Ils se connectent généralement directement à un LIMS, soit via une connexion série RS-232, soit via une interface réseau. Dans certains cas, un boîtier de conversion est nécessaire pour compléter une interface réseau-lit. Les balances ou les pH-mètres sont des exemples courants de ce type.
2. Instruments basés sur des fichiers
Un échelon plus haut sur l’échelle technologique, les instruments basés sur des fichiers peuvent être connectés à un PC qui collecte les données qu’ils créent. Le PC peut également effectuer une manipulation supplémentaire de ces données à l’aide d’un logiciel fourni par le fournisseur. Les données peuvent ensuite être exportées vers un lecteur local ou réseau pour une utilisation ultérieure.
Les données générées par les instruments basés sur des fichiers se présentent sous deux formats :
- Lisible par l’homme : des données qui ne nécessitent aucun logiciel spécial pour qu’un chercheur puisse les interpréter. Il peut être affiché avec des applications courantes trouvées sur la plupart des PC, telles que le Bloc-notes Windows.
- Non lisible par l’homme - Ce format nécessite l’affichage et/ou la manipulation des données par le logiciel propriétaire du fournisseur.
3. Instruments « intelligents »
Ces instruments modernes peuvent partager des données via plusieurs technologies, notamment le streaming, divers formats basés sur des fichiers, des services Web ou la solution d’intégration propriétaire d’un fournisseur. Les solutions d’entreprise de plus grande envergure, dans lesquelles une solution logicielle peut gérer plusieurs instruments en même temps, entrent également dans cette catégorie.
Parmi ces types d’instruments, citons les systèmes de données de chromatographie (CDS), tels qu’Empower ou Chromeleon.
Instruments multiples et défis de stockage des données brutes
Dans une configuration de laboratoire courante, les instruments « muets » seront directement liés au LIMS. Les résultats de ces instruments peuvent être stockés directement par rapport aux bons résultats, mais leurs données brutes ne sont pas stockées dans le lac de données scientifiques.
Les deux autres catégories peuvent stocker leurs résultats sous forme de fichiers. Il peut s’agir de :
- Un répertoire de fichiers local
- Un dossier réseau partagé
- Une solution basée sur le cloud, telle que le stockage dans le cloud AWS ou Azure.
Le problème avec la gestion de plusieurs instruments de cette manière est que les données brutes finissent par être stockées dans de nombreux emplacements différents. Cela peut créer de nombreux défis :
- Entretien de sites multiples : le service informatique doit gérer les sites séparément, avec différentes solutions de sauvegarde et de restauration des données.
- Durée de stockage : de nombreux laboratoires doivent conserver leurs données pendant 30 ans ou plus.
- Perte de données : les instruments seront remplacés au fil du temps, ce qui peut entraîner une perte de données. Les PC locaux contenant des données brutes peuvent également tomber en panne, une autre source courante de perte de données.
- Accessibilité : d’autres emplacements qui ont besoin de certaines données brutes peuvent ne pas être en mesure d’y accéder.
Le lac de données scientifiques
Un emplacement de stockage central, tel qu’un lac de données scientifiques, crée un emplacement unique pour toutes les données brutes, ce qui rend obsolètes les fichiers stockés localement, liés aux instruments eux-mêmes. Il devient un lieu principal où les données peuvent être récupérées depuis n’importe quel endroit du laboratoire ou de l’entreprise.
Le lac de données scientifiques peut surveiller le dossier de stockage local de chaque instrument et acquérir les données qui y sont stockées. Lors de l’acquisition, les informations clés peuvent être extraites des données brutes et stockées séparément dans une base de données, créant ainsi des paires clé-valeur qui peuvent être utilisées pour rechercher des données dans le lac de données scientifiques.
Les avantages d’un lac de données scientifiques sont les suivants :
- Entretien simple : le service informatique n’a besoin de gérer qu’un seul site lorsqu’il s’agit de sauvegarder et de restaurer des données.
- Accessibilité : toutes les données brutes sont accessibles par différents laboratoires partout dans l’entreprise.
- Minimiser la perte de données : le lac de données scientifiques devient l’emplacement principal de toutes les données, ce qui réduit les pertes de données.
- Éviter la duplication des tests : la mise à disposition des données à tous les membres de votre entreprise limite la duplication des analyses.
Plus qu’un simple stockage
Un lac de données scientifiques peut offrir d’énormes avantages simplement en optimisant le stockage des données. Cependant, une étape supplémentaire peut le rendre encore plus efficace. Pourquoi ne pas relier les données brutes du système LIMS directement aux échantillons créés ?
Voici comment cela fonctionne :
- Les données brutes générées lors des analyses contiendront des identifiants d’échantillons, des identifiants d’instruments et d’autres identifiants uniques d’objets actuellement dans le LIMS.
- Chaque fois que des données sont générées et stockées dans le lac de données scientifiques, les paires clé-valeur peuvent être utilisées pour s’assurer que les données brutes sont directement connectées aux enregistrements dans le système LIMS. Ainsi, chaque fois qu’un échantillon est visualisé dans LIMS, les données brutes correspondantes (disponibles dans le lac de données) sont accessibles à partir de cet enregistrement.
- Toutes les données brutes générées au sein du laboratoire ne sont plus stockées dans une grande base de données (c’est-à-dire le lac de données scientifiques). Au lieu de cela, LIMS crée une hiérarchie reliant toutes les données aux enregistrements appropriés. Voici quelques exemples :
- Afficher toutes les données brutes associées à un certain échantillon
- Afficher toutes les données brutes acquises par un certain instrument
- Une étude de stabilité complète peut être résumée, montrant toutes ses données brutes dans un résultat du LIMS
- Et bien d’autres possibilités...
L’avantage de LabVantage LIMS
LabVantage LIMS peut fournir un système de gestion des données scientifiques (SDMS) entièrement intégré prêt à l’emploi, créant ainsi un emplacement de stockage central pratique. Le SDMS surveillera les localisations vers lesquelles les instruments envoient leurs données, en interprétant et stockant les données qu’ils fournissent.
Les options de stockage suivantes sont disponibles :
- Emplacement des fichiers réseau
- Stockage de base de données
- Stockage cloud, tel qu’AWS et Azure
Tous ces emplacements ne sont accessibles que via le LIMS, ce qui permet de ne pas rompre le lien entre les données et les captures dans le LIMS. Si des analyses supplémentaires sont nécessaires, les données peuvent être à nouveau téléchargées à partir du LIMS.
Étant donné que le LIMS est un emplacement central pour les données, il fait automatiquement du SDMS l’emplacement central pour les données brutes.
Pour plus de détails sur ce processus et sur la façon dont un SDMS peut transformer les opérations de votre laboratoire, contactez-nous dès maintenant.
